Стенные Михайловские ворота монастыря расположены между Грановитой и Маринкиной башнями. Они были заложены (перекрыты) ещё в XVI веке, вскоре после основания монастыря. Во время реставрации в 1970-е гг их раскрыли, а вскоре через ров перекинули мост. В настоящее время ворота являются западным входом в монастырь.